ترجمه مقاله بازدید مجدد دسته بندی cath – معماری های بازبینی شده و روشهای جدید برای مشخص کردن واگرایی (انشعاب) ساختاری در فوق خانواده ها
رشته زیست شناسی-فنی و مهندسی
The CATH classification revisited—architectures reviewed and new ways to characterize structural divergence in superfamilies (2009)
- توضیحات: 5 صفحه انگلیسی، 10صفحه ترجمه آماده فارسی (word)
- چکیده ترجمه فارسی:
آخرین نسخه cath (طبقه , معماری , توپولوژی , هومولوژی) (نسخه 3.2) در ژولای 2008 انتشار یافت که حاوی 114215 , 2178 فوق خانواده همسان و 1110 گروه ترکیبی حوزه می باشد. ما 20330 حوزه جدید , 87 فوق خانواده همسان جدید و 26 خانواده ترکیبی جدید را از رمان انتشار نسخه 3.1 cath اختصاص داده ایم.28064 حوزه جدید از زمان انتشار دیتابیس NAR ما در سال 2007 اختصاص داده شده است. وبسایت cath تحت تجدید نظر کلی طراحی قرار گرفته و شامل مستندات قابل درک بیشتری شده است. ما سطح معماری cath را بعنوان بخشی از توسعه نمودار پروتئین مجددا ملاقات کرده و اطلاعات مربوط به اعضای هر گروه را ارائه داده ایم. الگوریتم مقایسه ساختار cathedral بهبود یافته و برای مشخص ساختن تنوع ساختاری در فوق خانواده های cath و همپوشانی های ساختاری بین فوق خانواده ها مورد استفاده قرار گرفته است. هرچند بخش عمده ای از فوق خانواده ها در cath از نظر ساختاری متفاوت نیستند و همپوشانی شاخصی با دیگر فوق خاواده ها ندارند , تقریبا 4% از فوق خانواده ها دارای تنوع زیاد بوده و اینها هستند که دارای جمعیت بیشتر در PDB و ژنومها می باشند. اطلاعت در زمینه درجه تنوع ساختاری در هر فوق خانواده و همپوشا نی های ساختاری بن فوق خانواده را می توان از وبسایت cath دانلود کرد.
فنی و مهندسی